FTP ou samba ?

Bonjour,
Dans le développement d'une application, j'archive des fichiers sur un serveur.
Mais voila, je ne sais pas quel serveur choisir : FTP ou samba ?
D'emblée, j'étais parti sur FTP car l'accès ne se ferait que par l'interface que je développerai. Mais, samba est qd meme la solution idéale au partage de fichiers.
Petites précisions techniques :
- il s'agit de pdf (on ne modifie pas les fichiers, pas d'accès concurrentiel)
- le réseau est à priori WAN, mais possibilité de faire plusieurs serveurs pour chaque LAN
- l'archivage (PUT) se fait également à partir d'une interface spécifique.
- Tous les clients sont sous Windows
- Le serveur sera probablement sous unix (ou GNU/linux)

Merci pour votre aide si vous pouvez me donner les différents arguments.

Chmanu